Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Srp72F8VQC1 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Srp72F8VQC1 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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