Protein–RNA interactions for Protein: F7BTS7

Gm5798, Predicted gene 5798, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5798F7BTS7 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
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Gm5798F7BTS7 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Gm5798F7BTS7 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Gm5798F7BTS7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Gm5798F7BTS7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Gm5798F7BTS7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Gm5798F7BTS7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Gm5798F7BTS7 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Gm5798F7BTS7 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Gm5798F7BTS7 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Gm5798F7BTS7 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Gm5798F7BTS7 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Gm5798F7BTS7 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Gm5798F7BTS7 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Gm5798F7BTS7 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5798F7BTS7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms