Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms