Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm27025-201ENSMUST00000182392 942 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm15878-201ENSMUST00000127561 306 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms