Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms