Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Gm43288-201ENSMUST00000197594 2628 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Gm40655-201ENSMUST00000220802 1880 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Samd1D3YXK1 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Samd1D3YXK1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Ccdc71-202ENSMUST00000193170 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Samd1D3YXK1 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Samd1D3YXK1 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Samd1D3YXK1 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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