Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Phf11bB4XVQ1 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Phf11bB4XVQ1 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Phf11bB4XVQ1 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms