Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms