Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otud4B2RRE7 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otud4B2RRE7 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otud4B2RRE7 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otud4B2RRE7 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms