Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf3B2RQG2 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms