Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NhsB1AV60 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NhsB1AV60 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NhsB1AV60 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NhsB1AV60 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NhsB1AV60 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NhsB1AV60 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NhsB1AV60 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NhsB1AV60 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NhsB1AV60 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NhsB1AV60 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NhsB1AV60 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NhsB1AV60 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NhsB1AV60 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NhsB1AV60 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NhsB1AV60 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NhsB1AV60 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NhsB1AV60 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NhsB1AV60 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NhsB1AV60 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NhsB1AV60 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NhsB1AV60 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NhsB1AV60 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NhsB1AV60 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NhsB1AV60 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NhsB1AV60 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NhsB1AV60 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NhsB1AV60 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NhsB1AV60 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NhsB1AV60 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NhsB1AV60 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NhsB1AV60 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NhsB1AV60 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NhsB1AV60 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms