Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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