Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttll11A4Q9F4 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms