Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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Atp8b5A3FIN4 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Atp8b5A3FIN4 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Atp8b5A3FIN4 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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