Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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