Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms