Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms