Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Robo3Q9Z2I4 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Robo3Q9Z2I4 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms