Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms