Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nubp2Q9R061 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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