Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms