Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnnt3Q9QZ47 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnt3Q9QZ47 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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