Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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Ndrg3Q9QYF9 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndrg3Q9QYF9 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndrg3Q9QYF9 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndrg3Q9QYF9 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndrg3Q9QYF9 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndrg3Q9QYF9 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndrg3Q9QYF9 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndrg3Q9QYF9 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndrg3Q9QYF9 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndrg3Q9QYF9 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Ndrg3Q9QYF9 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Ndrg3Q9QYF9 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Ndrg3Q9QYF9 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Ndrg3Q9QYF9 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Ndrg3Q9QYF9 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Ndrg3Q9QYF9 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Ndrg3Q9QYF9 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Ndrg3Q9QYF9 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndrg3Q9QYF9 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndrg3Q9QYF9 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Ndrg3Q9QYF9 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Ndrg3Q9QYF9 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Ndrg3Q9QYF9 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndrg3Q9QYF9 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndrg3Q9QYF9 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndrg3Q9QYF9 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndrg3Q9QYF9 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndrg3Q9QYF9 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndrg3Q9QYF9 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndrg3Q9QYF9 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndrg3Q9QYF9 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndrg3Q9QYF9 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndrg3Q9QYF9 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndrg3Q9QYF9 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndrg3Q9QYF9 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndrg3Q9QYF9 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndrg3Q9QYF9 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndrg3Q9QYF9 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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