Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms