Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms