Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms