Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Rabgef1Q9JM13 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Rabgef1Q9JM13 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Rabgef1Q9JM13 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Rabgef1Q9JM13 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Rabgef1Q9JM13 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Rabgef1Q9JM13 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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