Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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