Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FancaQ9JL70 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FancaQ9JL70 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FancaQ9JL70 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FancaQ9JL70 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FancaQ9JL70 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FancaQ9JL70 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FancaQ9JL70 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FancaQ9JL70 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FancaQ9JL70 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FancaQ9JL70 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms