Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms