Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ybx3Q9JKB3 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms