Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm30504-201ENSMUST00000209316 1688 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Ighv5-12-201ENSMUST00000103450 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Csta1-202ENSMUST00000161638 422 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm20610-201ENSMUST00000176406 587 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm21577-201ENSMUST00000190823 697 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm20802-201ENSMUST00000190832 698 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm18621-201ENSMUST00000222677 679 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 AC163646.3-201ENSMUST00000228879 772 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Fdps-201ENSMUST00000081848 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Ift22-204ENSMUST00000200153 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm31374-201ENSMUST00000213885 619 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 AC156633.1-201ENSMUST00000215971 614 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm5191-201ENSMUST00000222882 1236 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 3110083C13Rik-202ENSMUST00000224786 907 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Rps4l-ps-201ENSMUST00000059737 768 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm14153-201ENSMUST00000119923 1139 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm15699-201ENSMUST00000159213 280 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 AC127583.1-201ENSMUST00000224351 540 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm9531-201ENSMUST00000055820 638 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms