Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rnft1Q9DCN7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Rnft1Q9DCN7 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rnft1Q9DCN7 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rnft1Q9DCN7 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rnft1Q9DCN7 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rnft1Q9DCN7 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rnft1Q9DCN7 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rnft1Q9DCN7 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rnft1Q9DCN7 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rnft1Q9DCN7 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rnft1Q9DCN7 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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