Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Swt1Q9DBQ9 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Swt1Q9DBQ9 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Swt1Q9DBQ9 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Swt1Q9DBQ9 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Swt1Q9DBQ9 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Swt1Q9DBQ9 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Swt1Q9DBQ9 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Swt1Q9DBQ9 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms