Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Derl3Q9D8K3 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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