Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Tmem54Q9D7S1 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Tmem54Q9D7S1 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Tmem54Q9D7S1 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Tmem54Q9D7S1 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Tmem54Q9D7S1 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Tmem54Q9D7S1 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Tmem54Q9D7S1 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Tmem54Q9D7S1 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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