Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms