Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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