Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q9D2Q3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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