Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pramef12Q9D2F1 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pramef12Q9D2F1 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pramef12Q9D2F1 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pramef12Q9D2F1 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pramef12Q9D2F1 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms