Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms