Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp11Q9CZJ1 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp11Q9CZJ1 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms