Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Gm5082-203ENSMUST00000221920 1518 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl11Q9CXW4 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms