Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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