Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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