Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms