Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ykt6Q9CQW1 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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