Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms