Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9CQF4 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9CQF4 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms