Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nudt21Q9CQF3 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms